儿童甲亢的病因与成人相似。甲亢主要是甲状腺分泌甲状腺激素过多引起，甲亢的病因通常是甲状腺相关疾病。常见是弥漫性甲状腺肿，可引起甲状腺增生。其次是桥本氏甲状腺炎。由于自身抗体的存在，早期会破坏甲状腺，过多的甲状腺激素释放到血液中，出现短暂的甲状腺功能亢进。随甲状腺组织的进一步破坏，就会发生甲状腺功能减退。碘摄入过多，甲状腺激素合成增加，会发生甲亢。