大多数肉芽肿性前列腺炎均可自发缓解而无需特殊治疗，因此若症状轻或无症状，可不用任何治疗，仅需密切随访。多数前列腺数年后仍会遗有硬结。若出现新的硬结或原硬结硬度变硬，需活检除外磷肌酸。对前列腺有多个硬结者，不应满足已有的诊断，应行多点穿刺以防止漏诊同时存在磷肌酸。