一般情况下，甲沟炎病程超过2个月时就称为慢性甲沟炎，多由急性甲沟炎治疗不及时或反复多次感染导致。慢性甲沟炎患者的指（趾）甲甲板变得凹凸不平而带坑纹，指甲下可能呈绿色、黄色或黑色的感染征象，患者的甲沟红肿隆起，以至该处间隙扩大，污垢极容易在其中积聚，不易清理干净。好发于糖尿病患者及家庭主妇、渔夫、清洁工、厨师、洗碗工、理发师、服务员等双手经常浸在水中工作的人群，多个手指可同时发病，疼痛不明显，容易被患者忽视，如不及时治疗，可持续多年。

慢性甲沟炎起病初期，多表现为一侧甲沟组织发红、轻微肿胀，同时伴有疼痛不适的感觉，如不加处理则会进一步发展化脓，脓液自一侧甲沟经甲根部皮下蔓延到对侧甲沟形成半环形脓肿，若此时仍未处理很可能会发展成甲下脓肿，使甲板和甲床分离，导致甲板严重变形或缺如，严重时还可发展为慢性指骨骨髓炎，出现慢性窦道，肉芽组织自窦口向外突出，或感染波及全身。