通常情况下，西安医院治疗生殖器疱疹，是根据每个病情轻重决定费用。如果是简单的生殖器疱疹一般800元左右，如果感染了细菌，费用会在3500元左右。具体分析如下：
1.简单的生殖器疱疹：只是疱疹病毒引起的，在医生指导下开一些药物，比如阿昔洛韦胶囊、伐昔洛韦或溴夫定胶囊等药物治疗，短时间内就会治愈，可能花费800左右。
2.感染细菌：多是白色念珠菌感染，会引发水泡、疼痛、瘙痒等病症。此时，治疗生殖器疱疹时间会比较长，花费也会比较高，大概在3500元。